प्राणायाम करते समय कुछ सावधानियाँ रखनी अत्यंत आवश्यक है।

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भोजन कैसा हो - प्राणायाम की साधना करने वाले व्यक्ति को सदैव शुद्ध, सात्विक, पोष्टिक, रोगनाशक, स्निग्ध, सरस, अल्प और ताजा भोजन ग्रहण करना चाहिए। ऐसा भोजन करने से शरीर शीघ्र ही स्वस्थ, बलवान और सुंदर बन जाता है तथा मन में सद्गुणों का विकास होता है। सूखा-सूखा, सड़ा-बासी, तामसिक, अशुद्ध, रोगकारक भोजन कभी ग्रहण नहीं करना चाहिए। प्राणायाम के साधक को अधिक मिर्च-मसाले, तले-भुने, खट्टे, दुष्पाच्य खाद्य पदार्थों से बचना चाहिए और बोटल बंद पेय तथा डब्बा बंद  फूड्स आदि से दूर रहना चाहिए। इनसे शरीर अस्वस्थ, निर्बल, कुरूप हो जाता है तथा मन में दुर्गुण बढ़ते रहते हैं। योगाभ्यास करने वाले को सदैव शरीर को पुष्ट करने वाला सुमधुर, स्निग्ध, गौघृत, दूध, दही, मट्ठा, रसदार फल आदि सब धातुओं का पोषण करने वाला, रुचिकर तथा अपनी प्रकृति के अनुकूल ही भोजन करना चाहिए।

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संयम - प्राणायाम के साधक को अपने मन तथा इंद्रियों पर संयम रखना चाहिए। इन पर संयम करने से ही प्राणायाम का पूरा लाभ प्राप्त होता है। यदि मन चंचलता और पाप वासनाओं में ही फँसा रहेगा और इन्द्रियाँ दुष्कर्म में लगी रहेगी तो प्राणायाम का कुछ भी लाभ नहीं होगा। अतः मन और इंद्रियों को परमात्मा में स्थिर करके ही प्राणायाम करना चाहिए। प्राणायाम करते समय इधर-उधर नहीं देखना चाहिए। परमात्मा के अतिरिक्त अन्य कहीं भी ध्यान नहीं लगाना चाहिए। ओम् की ध्वनि के अतिरिक्त अन्य किसी ध्वनि को सुनने का प्रयास भी नहीं करना चाहिए।

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पूर्व तैयारी - प्राणायाम में सफलता प्राप्त करने के लिए उससे पहले की तैयारी बहुत महत्वपूर्ण है। इस तैयारी का अर्थ यह है कि शरीर में किसी प्रकार का मल, मूत्र, कफ आदि नहीं होना चाहिए। अर्थात प्राणायाम से पहले शरीर से मल-मूत्र आदि का विसर्जन हो जाना चाहिए तथा गला, नेत्र, नासिका के साथ-साथ संपूर्ण शरीर को जल स्नान द्वारा पूर्णता स्वच्छ करना चाहिए। शरीर अशुद्ध होने की दशा में प्राणायाम नहीं करना चाहिए, क्योंकि अंदर मल भरे हो और इस अवस्था में प्राणायाम करने से तो लाभ के स्थान पर हानि हो जाती है। इसलिए शरीर को अंदर-बाहर से पूर्णता शुद्ध कर लेना चाहिए।

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यथा शक्ति करें - कुछ लोग किसी अप्रमाणिक पुस्तक में पढ़कर, यूट्यूब, गूगल आदि से खोज कर, अन्य व्यक्ति को प्राणायाम करते हुए देखकर, किसी के कहने से, किसी के उत्साह बढ़ाने से, बलपूर्वक श्वास को अंदर-बाहर रोकने लगते हैं अथवा अत्यधिक बल लगाकर प्राणों को अंदर लेने और बाहर फेंकने का तीव्र गति से अभ्यास करते हैं। कुछ लोग तो प्राणों को बाहर या अंदर करके नासिका को बलपूर्वक बंद करके भी बैठ जाते हैं। इस प्रकार मनुष्य प्राणायाम या किसी भी क्रिया को अपनी शक्ति सामर्थ्य का विचार किए बिना ही इतने समय तक करने लगते हैं जितने समय किसी और को भी करते देखा हैं। इस प्रकार प्राणायाम करने से लाभ के स्थान पर हानि होने की संभावना रहती है। प्रत्येक व्यक्ति को अपने बल और सामर्थ्य के अनुसार ही प्राणायाम करना चाहिए। अर्थात जैसे ही थकान का अनुभव होने लगे उसी क्षण प्राणायाम रोक देना चाहिए तथा लंबे-लंबे और धीरे सांस लेकर शरीर को सामान्य अवस्था में लाना चाहिए।

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शरीर सहज, सीधा व सम रखें - प्राणायाम करते समय सुख पूर्वक आसन में बैठकर पीठ और ग्रीवा को सीधा रखें। दोनों हाथों की हथेलियों के ऊपरी भाग को घुटनों पर तथा अंगूठे और तर्जनी उंगली के अग्रभाग को मिलाकर रखें। शरीर को न अधिक कसे और न अधिक ढीला छोड़ें अर्थात शरीर को सम अवस्था में रखें।

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प्रकृति के अनुकूल - प्राणायाम की कुछ क्रियाओं से शरीर में गर्मी बढ़ती है, कुछ से शीतलता और कुछ से सामान्य तापमान रहता है। प्राणायाम के साधक को अपने शरीर की शीत या उष्ण प्रकृति को ध्यान में रखकर तथा बाहर का गर्मी या सर्दी का मौसम जानकर अभ्यास करना चाहिए। अर्थात शीतकाल में अधिक प्राणायाम किया जा सकता है यदि उष्ण प्रकृति भी है।  लेकिन यदि ग्रीष्म ऋतु में उष्ण प्रकृति की अवस्था में तीव्र गति से प्राणायाम करेंगे तो हानि हो सकती है। यदि शीत प्रकृति है तो शीतल करने वाले प्राणायाम नहीं करने चाहिए। समशीतोष्ण रखने वाले प्राणायाम किए जा सकते हैं।

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बन्ध सही लगाये - प्राणायाम करते समय शरीर में लगाए जाने वाले तीन बन्धो का ज्ञान होना अत्यंत आवश्यक है यह किसी योग्य गुरु से समझ कर करें। यहाँ पर हमने तीन बन्धों को समझाया है।

आसन कौन सा लगाये - प्राणायाम करते समय आसन का महत्वपूर्ण स्थान है। इसलिए पहले अपना आसन सिद्ध कर लेना चाहिए। सुख पूर्वक बैठने के लिए किसी एक आसन विशेष का अभ्यास कर लेना चाहिए। जिसमें कि बिना हिले-डुले देर तक बैठ सके। पद्मासन, सिद्धासन, सुखासन आदि  जिस किसी आसन में भी साधक सुख पूर्वक बैठकर प्राणायाम कर सके, उसी में करें।

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श्वास छाती/फेफड़ों में भरना, पेट में नहीं - प्राणायाम करते समय वायु को केवल फेफड़ों में ही भरना चाहिए, उदर में नहीं। साँस भरने से वक्ष स्थल ही फुलना चाहिए, पेट नहीं। यदि प्राणवायु को अंदर भरते समय उदर को बाहर की और बुलाया जाएगा तो प्राणायाम के लाभ के स्थान पर बहुत हानि हो जाएगी। इसका ध्यान रखना चाहिए।

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सामर्थ्य, समय व परिस्थिति का ध्यान रखें - प्राणायाम के अनेक प्रकार हैं, किंतु यह आवश्यक नहीं है कि प्रत्येक व्यक्ति सभी प्रकार के ही प्राणायाम करें। प्रत्येक मनुष्य को प्राणायाम करते समय अपनी शक्ति, अपनी आयु, शरीर, समय, रोग और परिस्थिति का गंभीरता पूर्वक विचार करने के बाद ही प्राणायाम करना चाहिए। कहने का तात्पर्य यह है कि व्यक्ति को वही प्राणायाम करने चाहिए जो उसके अनुकूल अर्थात उसके लिए लाभप्रद हो। जिन प्राणायाम से व्यक्ति को कष्ट होता है वे उसे कदापि नहीं करना चाहिए। प्राणायाम की सभी क्रियाएँ सब के अनुकूल नहीं होती। यह आवश्यक नहीं है कि जो प्राणायाम एक व्यक्ति के लिए लाभकारी है वह दूसरे व्यक्ति के लिए भी लाभकारी ही हो। अतः प्रत्येक व्यक्ति को अपने अनुकूल प्राणायाम ही करना चाहिए।

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कम से कम जिसने योग दर्शन आयुर्वेद आदि का विधिवत अध्ययन न किया हो, केवल पुस्तक में पढ़कर, किसी से सुनकर अथवा किसी व्यक्ति को करते देखकर, टीवी, यूट्यूब या अन्य स्रोत से स्वेच्छापूर्वक करने से लाभ के स्थान पर हानि हो सकती है। इसलिए प्राणायाम व ध्यान करने से पहले किसी सुयोग्य और साधक गुरु से ही प्राणायाम की शिक्षा-दीक्षा लेकर प्राणायाम करना चाहिए।

प्राणायाम वही है जो योग दर्शन में महर्षि पतंजलि ने वर्णित किए हैं। अन्य सभी साँस लेने की पद्धतियाँ प्राणायाम नहीं है। वह सब क्रियाएँ हैं। जैसे कपालभाति, अनुलोम-विलोम, उज्जायी आदि क्रियाओं को भी किसी योग्य गुरु से ही सीखना चाहिए।